十年基础科研摔坑换得的经验教训总结
去年帮所里评青年基金,翻了快三十份申报书,有个现象越看越心惊。接近八成的预实验数据,漂亮得像P出来的。
科研预实验错误筛选数据手写记录稿
说实话,现在太多新人被顶刊的漂亮结果PUA了。看到杂志上发的图个个干净规整,就觉得自己做出来歪歪扭扭就是技术不行,必须删删减减凑出漂亮结果才行。
这里说句掏心窝子的话:异常值肯定要排除,但排除的前提是这个异常是操作失误导致的——比如细胞染菌了,小鼠给药打错了,电泳跑胶漏了样品,这种删了没问题。但就因为结果不符合你提前想的假说就删,那不是做科研,那是编故事。
编故事一时爽,结题火葬场。我见过好几个天份不错的青椒,就因为第一次申项目走了这条路,后续三五年都出不了成果,职称评不上,项目拿不到,硬生生把路走窄了。
不过话说回来,我前年申重点项目,反而特意把一组重复不出来的预实验数据放进去了,老老实实写“本部分作用机制尚不明确,存在不确定性,本项目将重点解答这一疑问”,结果反而中了。后来问评审专家,说现在见多了完美得离谱的预实验,你敢把不完美放出来,反而说明你态度扎实,没玩虚的。
实验室重复顶刊实验原始数据记录本
现在多少人做科研,就是跟风追热点。顶刊发什么什么是新方向,大家一拥而上挤破头,人家说什么对就跟着说什么对,根本不会想,这个结果到底对不对?为什么我做出来不一样?
真的,很多人拿到不符合预期的结果,第一反应就是我错了,我实验做砸了,直接把数据塞硬盘角落吃灰。但实际上,绝大多数真正有价值的成果,都是从这些“做砸了”的实验里长出来的。
我不是让你为了抢眼球故意推翻前人结论,那种抬杠式的研究也没意义。我是说,当你反复验证结果都和主流不一样的时候,别先急着否定自己,停下来想想,会不会是原来的结论本来就有问题?说不定你捡着大宝贝了。
课题组的摔坑经验,别烂在老教授的旧笔记本里
我们所里前年退休一个做了四十年植物病理的老教授,一辈子攒了几十本野外实验记录,还有上百株他自己分离保存的地方菌株,结果搬家的时候,儿女觉得这些旧本子放着占地方,当废纸卖了,几十本摞得比人高的记录,卖了二十二块钱。所里知道的时候,全所老人都心疼得直叹气。
很多课题组现在都有这个问题:课题组的隐性经验全靠口口相传,老员工摔过的坑,总结的教训,要么写在私人笔记本里,要么只传给自己带的学生,整个课题组根本没有沉淀下来。新人进来,一切从零开始,把前辈踩过的坑再挨个踩一遍,等你爬出来,博士都毕业了,大好时光全浪费在重复踩坑上。
我刚进实验室读博的时候,做WB转膜,转十次有八次要么转飞要么转不均匀,折腾了快一个月都没解决,后来大师兄偷偷给我说了个小技巧:转膜的时候冰浴槽里放个小磁珠,开最低速搅拌,让槽里温度均匀,就不会出问题。我一试,成了,就这么一句话,省了我至少一个月的功夫。
这种小技巧,这种踩过坑的经验教训,哪个顶刊会发?不会的。只有前辈告诉你,你才知道。不然你自己摸索,不知道要浪费多少时间。
我们课题组现在定了个死规矩:每个在研项目都建一个公开的共享文档,不管是做出来的阳性结果,还是做死了的阴性结果,谁踩了什么坑,怎么绕出来的,全部写进去。新生入学第一件事,不是开做实验,是翻完所有项目的经验记录。就这一招,我们课题组新人出成果的速度,至少快了一年半。
科研这一路,哪有什么一帆风顺的天选之子。你看到的都是顶刊上光鲜亮丽的结果,看不见的是实验室垃圾桶里堆得像山一样的废胶片,是硬盘里几十个G重复不出来的原始数据,是无数个熬到凌晨的深夜。
那些摔过的疼,拿不到项目的焦虑,发不出文章的自我怀疑,其实才是科研给你最值钱的东西。对吧?走不通的路记下来,下次别再摔进去,就已经比大多数人走得快了。
别拿完美预实验骗自己,不合理筛选数据迟早坑自己
我刚工作申第一个青年项目的时候,也干过这事。那时候满脑子就想中项目,出结果,预实验做了六组重复,两组不符合我的预设假设,直接删掉,剩下四组刚好差异显著,完美符合假说,还美其名曰排除个体差异。 结果项目中了之后,开干做了两年,一次都重复不出来。那段时间我天天蹲在细胞房,看着培养瓶里的细胞,连骂人的力气都快没了,差点申请转岗去搞行政。
科研预实验错误筛选数据手写记录稿
说实话,现在太多新人被顶刊的漂亮结果PUA了。看到杂志上发的图个个干净规整,就觉得自己做出来歪歪扭扭就是技术不行,必须删删减减凑出漂亮结果才行。
这里说句掏心窝子的话:异常值肯定要排除,但排除的前提是这个异常是操作失误导致的——比如细胞染菌了,小鼠给药打错了,电泳跑胶漏了样品,这种删了没问题。但就因为结果不符合你提前想的假说就删,那不是做科研,那是编故事。
编故事一时爽,结题火葬场。我见过好几个天份不错的青椒,就因为第一次申项目走了这条路,后续三五年都出不了成果,职称评不上,项目拿不到,硬生生把路走窄了。
不过话说回来,我前年申重点项目,反而特意把一组重复不出来的预实验数据放进去了,老老实实写“本部分作用机制尚不明确,存在不确定性,本项目将重点解答这一疑问”,结果反而中了。后来问评审专家,说现在见多了完美得离谱的预实验,你敢把不完美放出来,反而说明你态度扎实,没玩虚的。
别迷信顶刊的标准答案,不符合预期的结果才是金矿
前两年我们领域出了个大瓜,Nature发了一篇顶级研究说某受体能显著抑制肿瘤生长,全世界几十个课题组跟着跟风砸钱做,结果一大半重复不出来,最后闹了半天,原作者实验用的细胞系认错了,歪打正着出了个假结果。 这种事真不是偶发。我自己十年前就踩过一模一样的坑。当年Cell发了一篇大牛的研究,说某通路调控干细胞分化,我们课题组当时刚拿到面上项目,全组砸进去两年时间,就想顺着这个方向做,冲一篇大文章。结果我们换了三个不同来源的细胞系,换了三种测序方法,所有结果都和大牛的结论完全相反。 当时老板天天骂我们技术不行,操作太烂,我们也觉得是自己的问题,熬了大半年夜反复调条件,结果还是不对。最后逼得没办法,干脆咬咬牙,索性顺着我们自己的结果做,把相反的结论整理成文章投出去,反而发了领域内顶刊,后来还拿了省级科技奖。
实验室重复顶刊实验原始数据记录本
现在多少人做科研,就是跟风追热点。顶刊发什么什么是新方向,大家一拥而上挤破头,人家说什么对就跟着说什么对,根本不会想,这个结果到底对不对?为什么我做出来不一样?
真的,很多人拿到不符合预期的结果,第一反应就是我错了,我实验做砸了,直接把数据塞硬盘角落吃灰。但实际上,绝大多数真正有价值的成果,都是从这些“做砸了”的实验里长出来的。
我不是让你为了抢眼球故意推翻前人结论,那种抬杠式的研究也没意义。我是说,当你反复验证结果都和主流不一样的时候,别先急着否定自己,停下来想想,会不会是原来的结论本来就有问题?说不定你捡着大宝贝了。
课题组的摔坑经验,别烂在老教授的旧笔记本里
课题组的摔坑经验,别烂在老教授的旧笔记本里
我们所里前年退休一个做了四十年植物病理的老教授,一辈子攒了几十本野外实验记录,还有上百株他自己分离保存的地方菌株,结果搬家的时候,儿女觉得这些旧本子放着占地方,当废纸卖了,几十本摞得比人高的记录,卖了二十二块钱。所里知道的时候,全所老人都心疼得直叹气。
很多课题组现在都有这个问题:课题组的隐性经验全靠口口相传,老员工摔过的坑,总结的教训,要么写在私人笔记本里,要么只传给自己带的学生,整个课题组根本没有沉淀下来。新人进来,一切从零开始,把前辈踩过的坑再挨个踩一遍,等你爬出来,博士都毕业了,大好时光全浪费在重复踩坑上。
我刚进实验室读博的时候,做WB转膜,转十次有八次要么转飞要么转不均匀,折腾了快一个月都没解决,后来大师兄偷偷给我说了个小技巧:转膜的时候冰浴槽里放个小磁珠,开最低速搅拌,让槽里温度均匀,就不会出问题。我一试,成了,就这么一句话,省了我至少一个月的功夫。
这种小技巧,这种踩过坑的经验教训,哪个顶刊会发?不会的。只有前辈告诉你,你才知道。不然你自己摸索,不知道要浪费多少时间。
我们课题组现在定了个死规矩:每个在研项目都建一个公开的共享文档,不管是做出来的阳性结果,还是做死了的阴性结果,谁踩了什么坑,怎么绕出来的,全部写进去。新生入学第一件事,不是开做实验,是翻完所有项目的经验记录。就这一招,我们课题组新人出成果的速度,至少快了一年半。
科研这一路,哪有什么一帆风顺的天选之子。你看到的都是顶刊上光鲜亮丽的结果,看不见的是实验室垃圾桶里堆得像山一样的废胶片,是硬盘里几十个G重复不出来的原始数据,是无数个熬到凌晨的深夜。
那些摔过的疼,拿不到项目的焦虑,发不出文章的自我怀疑,其实才是科研给你最值钱的东西。对吧?走不通的路记下来,下次别再摔进去,就已经比大多数人走得快了。